利用16个微卫星标记分析6个鸭品种的遗传多样性

doi:10.16036/j.issn.1000-2650.2019.02.011

四川农业大学学报 ›› 2019, Vol. 37 ›› Issue (02): 221-226.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2019.02.011

利用16个微卫星标记分析6个鸭品种的遗传多样性

王统苗¹, 常国斌¹, 白皓², 江勇¹, 张扬¹, 王志秀¹, 张莘¹, 刘本帅¹, 陈国宏^1,*

1.扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州 225009;
2.扬州大学农业科技发展研究院/教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室,江苏扬州 225009

收稿日期:2018-11-23 出版日期:2019-04-28 发布日期:2021-01-29
作者简介:王统苗,硕士研究生。^*责任作者：陈国宏,教授,博士生导师,主要从事动物遗传育种方面的研究,E-mail：ghchen@yzu.edu.cn。
基金资助:
国家重点研发计划项目（2018YFD0501503）; 江苏省农业科技自主创新资金项目（CX（18）1004）

Analysis of Genetic Diversity of 6 Duck Populations Using 16 Microsatellite Markers

WANG Tongmiao¹, CHANG Guobin¹, BAI Hao², JIANG Yong¹, ZHANG Yang¹, WANG Zhixiu¹, ZHANG Xin¹, LIU Benshuai¹, CHEN Guohong^1,*

1. College of Animal Science and Technology,Yangzhou University,Yangzhou 225009,Jiangsu,China;
2. Joint International Research Laboratory of Agriculture and Agri-Product Safety,the Ministry of Education of China/ Institutes of Agricultural Science and Technology Development,Yangzhou University,Yangzhou 225009,Jiangsu,China

Received:2018-11-23 Online:2019-04-28 Published:2021-01-29

摘要/Abstract

摘要： 【目的】为系统评价润州凤头白鸭、连城白鸭、北京鸭、樱桃谷鸭、吉安红毛鸭和于田麻鸭6个鸭品种的遗传多样性。【方法】利用16个微卫星位点（STR分型技术）对6个鸭品种（各30只）的遗传多样性参数进行检测并进行聚类分析。【结果】16个微卫星位点共检测到141个等位基因,多态信息含量（PIC）介于0.25~0.60之间,其中,9个座位为高度多态位点（PIC>0.50）,7个座位为中度多态位点（0.25<PIC<0.50）;6个鸭品种在微卫星座位的平均杂合度在0.385 4~0.518 7;聚类分析结果表明,润州凤头白鸭先与于田麻鸭聚为一类,再与连城白鸭聚为一类;北京鸭先与樱桃谷鸭聚为一类,再与吉安红毛鸭聚为一类。【结论】6个鸭品种遗传多样性丰富,反映了中国地方鸭品种间遗传多样性的差异。

关键词: 微卫星标记, 遗传多样性, 鸭, 聚类分析

Abstract: 【Objective】 To systematically evaluate the genetic diversity of the six duck breeds, namely Runzhou Crested White Duck, Liancheng White Duck, Peking Duck, Cherry Valley Duck, Ji'an Red Haired Duck and Yutian Ma Duck. 【Method】 Sixteen microsatellite loci (STR typing technique) were used to detect the genetic diversity parameters of six duck breeds (30 ducks each breed). 【Result】 A total of 141 alleles were detected at 16 microsatellite loci, and the polymorphic information content (PIC) ranged from 0.25 to 0.60. Among them, 9 loci were highly polymorphic loci (PIC>0.50), 7 loci were moderately polymorphic loci (0.25<PIC<0.50), and the average heterozygosity of 6 duck breeds at microsatellite loci was 0.385 4~0.518 7. Cluster analysis showed that Runzhou Crested White Duck gathered with Yutian Ma Duck in the first category, and then grouped with Liancheng White Ducks; Peking Ducks and Cherry Valley Ducks are grouped together, and then together with Ji'an Red Haired Ducks.【Conclusion】 The results showed that six duck breeds had abundant genetic diversity, which also reflected the difference of genetic diversity among Chinese local duck breeds.

Key words: microsatellite markers, genetic diversity, duck, cluster analysis

中图分类号:

S834.2

王统苗, 常国斌, 白皓, 江勇, 张扬, 王志秀, 张莘, 刘本帅, 陈国宏. 利用16个微卫星标记分析6个鸭品种的遗传多样性[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 221-226.

WANG Tongmiao, CHANG Guobin, BAI Hao, JIANG Yong, ZHANG Yang, WANG Zhixiu, ZHANG Xin, LIU Benshuai, CHEN Guohong. Analysis of Genetic Diversity of 6 Duck Populations Using 16 Microsatellite Markers[J]. Journal of Sichuan Agricultural University, 2019, 37(02): 221-226.

参考文献

[1] CROOIJMANS R P, GROEN A F, VAN KAMPEN A J, et al. Microsatellite polymorphism in commercial broiler and layers lines estimated using pooled blood samples[J]. Poult Sci, 1996, 75(7): 904-909.
[2] ROMANOV M N, WEIGEND S.Genetic diversity in chicken populations based on microsatellite markers[A]. In Proceedings of the conference"From Jay Lush to Genomics: Vidions for Animal Breeding and Genetics"[C]. USA: Ames Iowa, 1999, 17.
[3] 吴艳, 侯水生, 刘小林, 等. 4个微卫星标记分析6个鸭群体之间的遗传关系[J]. 畜牧兽医学报, 2006, 37(4): 389-395.
[4] 张燕, 方琪, 陈兴勇, 等. 利用微卫星标记分析4个番鸭品系的遗传多样性[J]. 浙江农业科学, 2015, 56(4): 558-560.
[5] 张扬, 朱振, 黄种彬, 等. 福建省5个地方鸭品种的遗传多样性分析[J]. 中国畜牧杂志, 2013, 49(23): 18-22.
[6] 王彬. 凤头白鸭与连城白鸭生产性能、遗传结构和部分凤头性状相关基因比较[D]. 扬州: 扬州大学, 2015.
[7] 李应丰. 连城白鸭遗传资源调查报告[J]. 中国畜禽种业, 2018(3): 134-136.
[8] 尹郁荪. 肉蛋兼用型特色鸭种:吉安红毛鸭[J]. 农村百事通, 2004(16): 36.
[9] J. 萨姆布鲁克, DW拉塞尔, Joseph Sam brook, 等. 分子克隆实验指南[M]. 3版. 北京: 科学出版社, 2002: 463-470.
[10] 朱志明, 陈晖, 郑嫩珠, 等.利用8个微卫星标记分析7个鸭群体的遗传多样性[J]. 中国畜牧杂志, 2010, 46(17): 10-13.
[11] 李慧芳, 李碧春, 陈宽维, 等. 中国地方鸭品种资源的分子遗传多样性[J]. 畜牧兽医学报, 2006, 37(11): 1107-1113.
[12] 张扬. 我国部分地方鸭品种遗传多样性与群体结构分析[D]. 扬州: 扬州大学, 2014.
[13] BOTESTEIN D, WHITE R L, SKOLNICK M, et al.Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphismas[J]. Am J Hum Genet, 1980, 32: 313-331.
[14] NEI M, ROY CHOUDHURY A K. Sampling variances of heterozygosity and genetic distance[J]. Genetics, 1974, 76: 379-390.
[15] NEI M.Genetic distance between populations[J]. American Naturalist, 1972, 106(949): 283-292.
[16] 鄢绯寰, 左正宏, 吕良炬, 等. 我国几种野鸭和家鸭遗传多样性的SSR分析[J]. 厦门大学学报(自然科学版), 2009, 48(3): 435-440.
[17] 肖天放, 柯柳玉, 张力, 等. 利用微卫星标记研究鸭品种的遗传多样性[J]. 应用生态学报, 2009, 20(1): 190-196.

利用16个微卫星标记分析6个鸭品种的遗传多样性

Analysis of Genetic Diversity of 6 Duck Populations Using 16 Microsatellite Markers

PDF (PC)

赞

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

Metrics

本文评价

推荐阅读 10

[1]	苗小猛, 刘嘉, 韩雪, 李亮, 周景瑞, 吴仙, 伍革民, 张洁, 徐景峨, 蒲龄, 陶宇航. 三穗鸭早期生长曲线拟合及10周龄体尺性状分析[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(06): 749-754.
[2]	林赛男, 田蓬鹏, 李冬梅. 农业特色小镇竞争力评价与提升对策研究——基于四川省30个镇的实证[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(06): 764-774.
[3]	林霄, 贺煜, 程安春, 汪铭书, 贾仁勇, 朱德康, 刘马峰, 杨乔, 吴英, 赵新新, 张沙秋, 黄娟, 刘韵雅, 张玲, 潘磊昌, 欧旭敏, 毛塞, 陈舜. 鸭坦布苏病毒NS3蛋白的原核表达及其多克隆抗血清的制备[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(05): 619-623.
[4]	孟逸凡, 秦丹, 孟庆瑞. 8个藤本月季品种核型比较分析[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(05): 545-550.
[5]	江勇, 杨婷铄, 唐静, 谢明, 张云生, 陈国宏, 侯水生. 苏氨酸缺乏和饲粮限饲对北京鸭生长性能和血浆生化指标的影响[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(05): 614-618.
[6]	谢健. 赤皮青冈天然林优势种群间关系及生态种组划分[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(02): 127-134.
[7]	翁恺麒, 霍蔚然, 张扬, 徐琪, 陈国宏. 中国地方鹅品种体量、繁殖性能与生态特征的主成分分析[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(02): 225-233.
[8]	郭国业, 徐莺, 唐琳, 陈放, 韩学琴. 不同地理种源麻疯树表型变异研究[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(02): 143-151.
[9]	赵艺璇, 王鑫, 田琳, 李明阳, 刘易超, 刘冬云. 39个木槿品种亲缘关系SRAP分析[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(01): 52-57.
[10]	邹瑞, 张玥, 杨自云, 蓝增全, 吴田. 紫娟茶自然杂交后代的ISSR分析[J]. 四川农业大学学报, 2020, 38(01): 87-91.
[11]	刘冠群, 吴祠平, 谭礼强, 谭杰, 杨婉君, 唐茜. 利用SSR分子标记构建名山茶树基因身份证[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(04): 469-474.
[12]	许倩, 刘良国, 黄文轩, 林青青, 邓勇, 吴丹, 杨品红. 沅水五强溪水库大鳍鱯的遗传多样性分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 253-258.
[13]	刘彬, 陈映, 李强, 郭芝忺, 何志平, 杨东丽, 钟志君, 张顺华, 朱砺. 我国规模化猪场种母猪繁殖与生产水平现状的调查研究[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 266-270.
[14]	陈朝阳, 易晓余, 熊君, 杨珂, 许珂, 匡成浩, 张志鹏, 丁丽, 蒲至恩, 陈国跃, 李伟. 118个小麦新品系的农艺性状和分子标记评价[J]. 四川农业大学学报, 2018, 36(06): 722-728.
[15]	梁家充, 朱兰, 孙利民, 杨红远, 袁跃云, 李东江, 洪琼花. 云南地方绵羊品种遗传多样性分子评价[J]. 四川农业大学学报, 2018, 36(06): 822-830.