四川农业大学学报 ›› 2010, Vol. 28 ›› Issue (04): 397-402.doi: 10.3969/j.issn.1000-2650.2010.04.001
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新麦草(Psathyrostachys juncea)两个高分子量谷蛋白亚基基因上游序列的克隆与分析
杨帆, 颜泽洪, 代寿芬, 韩畅, 胡喜贵
- 四川农业大学小麦研究所, 四川 温江 611130
Isolation and Characterization of Upstream Sequences of Two High-Molecular-Weight Glutenin Subunit Genes from Psathyrostachys juncea
YANG Fan, YAN Ze-hong, DAI Shou-fen, HAN Chang, HU Xi-gui
- Triticeae Research Institute, Sichuan Agricultural University, Wenjiang 611130, Sichuan, China
摘要： 应用PCR技术对新麦草PI429801和PI406469的高分子量谷蛋白基因上游序列进行了克隆,得到长度分别为998和1000 bp的HMW-N1和HMW-N2序列。比较发现,HMW-N1与麦类HMW-GS基因上游序列一致性在85%以上,与滨麦(Leymus mollis)序列DQ073542一致性最高,达98%;HMW-N2与麦类HMW-GS基因上游序列一致性在81%以上,与二角山羊草(Aegilops bicornis)序列AY611726一致性最高,达98%。系统进化分析表明,HMW-N1与含Ns染色体组的赖草属物种的同源基因序列DQ073551、FJ600498和DQ073546亲缘关系最近,HMW-N2却与含D染色体组节节麦和普通小麦的同源基因序列FJ008134、AY248704和DQ537337以及含S染色体组的山羊草物种的同源基因序列AY611726、AY611721和AY611724的亲缘关系较近。同时,HMW-N1和HMW-N2也具有E-box、N-box、partial Enhancer、complete Enhancer、TATA-box和Start等高分子量谷蛋白基因启动子区域的典型特征。本研究结果可为新麦草高分子量谷蛋白基因的克隆提供帮助,对从新麦草属以及其他小麦近缘属物种中分离未知高分子量谷蛋白基因有参考价值和借鉴意义。
中图分类号:
- S54
