SCOT标记分析抗菌核病油菜资源的遗传多样性

doi:10.16036/j.issn.1000-2650.2015.04.001

四川农业大学学报 ›› 2015, Vol. 33 ›› Issue (04): 351-356.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2015.04.001

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SCOT标记分析抗菌核病油菜资源的遗传多样性

张羽¹, 张晓娟¹, 陈进², 孙晓敏², 折建霞¹

1. 陕西理工学院生物科学与工程学院, 陕西汉中 723000;
2. 陕西省汉中市农业科学研究所, 陕西汉中 723000

收稿日期:2015-08-14 出版日期:2015-12-31 发布日期:2017-02-28
作者简介:张羽,教授,硕士,研究方向:遗传学理论与实践等方面的教学和科研工作,E-mail:zy68169@sina.com。
基金资助:
陕西省农业厅项目"早熟优质多抗高产油菜新品种选育及农机农艺配套关键技术研究与应用";陕西省教育厅项目"陕南地区抗菌核病油菜资源筛选(14JK1152)"

Genetic Diversity of Brassica napus in Resistance to Sclerotinia sclerotiorum Based on SCOT Markers

ZHANG Yu¹, ZHANG Xiao-juan¹, CHEN Jin², SUN Xiao-min², SHE Jian-xia¹

1. School of Biological Sciences and Engineering, Shaanxi University of Technology, Hanzhong 723000, Shaanxi, China;
2. Hanzhong Institute of Agricultural Sciences, Hanzhong 723000, Shaanxi, China

Received:2015-08-14 Online:2015-12-31 Published:2017-02-28

摘要/Abstract

摘要： [目的] 探索SCOT标记在油菜遗传多样性研究中的应用。[方法] 以8份具有代表性的甘蓝型油菜品种(系),对130个SCOT引物进行筛选。综合考虑多态性的大小,条带的清晰度,筛选出40个SCOT引物作为核心引物,对43份在田间接种鉴定表现抗菌核病的油菜材料进行遗传多样性分析。[结果] SCOT标记共检测到372个位点,每个引物可以检测到5~12个多态性位点,多态性信息含量值(PIC)介于0.25~0.99,平均值为0.65。供试材料的遗传相似系数集中在0.60~0.88之间。遗传相似度较高,亲缘关系较近。[结论] SCOT标记可以用于油菜遗传多样性的研究。

关键词: SCOT标记, 油菜, 遗传多样性

Abstract: [Objective] The aim of the study was to explore the utilization of start codon targeted polymorphism(SCOT) molecular marker technique in genetic diversity assessment in Brassica napus. [Method] 8representative rape materials were used as templates and 130 SCOT marker primers were screened out. 40 of them showed specific bands and highly polymorphism. The genetic diversity of 43 Sclerotinia sclerotiorum resistant rape materials that was identified in the field were analyzed. [Results] Total 372 alleles were verified using SCOT markers and? about approximately 5-12 alleles were detected by each SCOT marker. Genetic polymorphism information content of each SCOT locus was between 0.25 to 0.99, with a mean value of 0.65. The genetic similarity coefficient ranged from 0.60 to 0.88. Tenetic diversity level of these tea materials was relatively high in this study. [Conclusion] SCOT marker is suitable to explore the genetic diversity of rape germplasm.

Key words: SCOT markers, rape, genetic polymorphism

中图分类号:

S565.4

张羽, 张晓娟, 陈进, 孙晓敏, 折建霞. SCOT标记分析抗菌核病油菜资源的遗传多样性[J]. 四川农业大学学报, 2015, 33(04): 351-356.

ZHANG Yu, ZHANG Xiao-juan, CHEN Jin, SUN Xiao-min, SHE Jian-xia. Genetic Diversity of Brassica napus in Resistance to Sclerotinia sclerotiorum Based on SCOT Markers[J]. jsau, 2015, 33(04): 351-356.

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SCOT标记分析抗菌核病油菜资源的遗传多样性

Genetic Diversity of Brassica napus in Resistance to Sclerotinia sclerotiorum Based on SCOT Markers

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