猬草属与其近缘属物种的RAPD和ISSR分析

doi:10.16036/j.issn.1000-2650.2008.01.001

四川农业大学学报 ›› 2008, Vol. 26 ›› Issue (01): 5-10.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2008.01.001

猬草属与其近缘属物种的RAPD和ISSR分析

张海琴¹, 周永红¹, 杨瑞武², 丁春邦², 张利², 魏育明¹

1. 四川农业大学小麦研究所, 四川都江堰 611830;
2. 四川农业大学生命科学与理学院, 四川雅安 625014

收稿日期:2007-09-03 出版日期:2008-03-31 发布日期:2017-02-28
基金资助:
国家自然科学基金(30270099,30470135);四川省教育厅和科技厅重点项目;四川农业大学青年基金项目(01130500)

Phylogenetic Relationships among Hystrix, Psathyrostachys and Leymus(Poaceae: Triticeae) Based on RAPD and ISSR Assays

ZHANG Hai-qin¹, ZHOU Yong-hong¹, YANG Rui-wu², DING Chun-bang², ZHANG Li², WEI Yu-ming¹

1. Triticeae Research Institute, Sichuan Agricultural University, Dujiangyan 611830, Sichuan, China;
2. College of Biology and Science, Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, Sichuan, China

Received:2007-09-03 Online:2008-03-31 Published:2017-02-28

摘要/Abstract

摘要： 对猬草属及其近缘属(新麦草属、赖草属)物种11种1变种共13份材料进行了RAPD和ISSR分析。聚类分析结果表明:①新麦草属物种和赖草属物种各自聚类在一起;②猬草属模式种Hystrix patula与其他猬草属物种间存在明显的遗传差异;③Hystrix coreana、H. duthiei ssp. duthiei和H. duthiei ssp. longearistata与含Ns基因组的新麦草属物种及具NsXm基因组的赖草属物种聚在一起。以上结果与细胞学结果类似,表明H. patula与其他猬草属物种存在较大的遗传变异,而H. coreana、H. duthiei ssp. duthiei和H. duthiei ssp. longearistata与新麦草属及赖草属物种具有较近的亲缘关系。两种标记得到的Jaccard遗传相似系数和遗传聚类图基本一致,但ISSR引物扩增的多态性高于RAPD标记,且PCR扩增反应优于RAPD反应。RAPD和ISSR标记可作为评价小麦族物种遗传多样性和亲缘关系的分子标记技术。

关键词: 猬草属, 新麦草属, 赖草属, RAPD, ISSR

Abstract: The phylogenetic relationships of 12 taxa from Hystrix and the related species in Psathyrostachys and Leymus were analyzed by using RAPD and ISSR assays. H. coreana, H. duthiei ssp. duthiei and H. duthiei ssp. longearistata were clustered with the Psathyrostachys and Leymus species, while H. patula, the type species of Hystrix, formed a monophyletic branch. The results were in agreement with previously cytological data, and indicated that: ①H. patula was distantly related to the other species of Hystrix; ②H. coreana, H. duthiei ssp. duthiei and H. duthiei ssp. longearistata had a close affinity with the Psathyrostachys and Leymus specie. The RAPD and ISSR assays in this study produced similar UPGMA dendrograms, but the ISSR technique was superior to the RAPD assay in polymorphism and the stability of PCR reaction. RAPD and ISSR were two useful makers for assessing the genetic diversity and phylogenetic relationships in Tiritceae.

Key words: Hystrix, Psathyrostachys, Leymus, RAPD, ISSR

中图分类号:

Q944.46

张海琴, 周永红, 杨瑞武, 丁春邦, 张利, 魏育明. 猬草属与其近缘属物种的RAPD和ISSR分析[J]. 四川农业大学学报, 2008, 26(01): 5-10.

ZHANG Hai-qin, ZHOU Yong-hong, YANG Rui-wu, DING Chun-bang, ZHANG Li, WEI Yu-ming. Phylogenetic Relationships among Hystrix, Psathyrostachys and Leymus(Poaceae: Triticeae) Based on RAPD and ISSR Assays[J]. jsau, 2008, 26(01): 5-10.

[1]	许倩, 刘良国, 黄文轩, 林青青, 邓勇, 吴丹, 杨品红. 沅水五强溪水库大鳍鱯的遗传多样性分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 253-258.
[2]	宋倩倩. 福建省浙江红花油茶遗传多样性的ISSR分析[J]. , 2017, 35(03): 0-0.
[3]	陈云霞, 南程慧. 珍稀濒危植物宝华玉兰遗传多样性的ISSR分析[J]. 四川农业大学学报, 2016, 34(04): 445-449.
[4]	王英, 骆嘉言, 钟文翰, 石江涛, 樊帅. 3种楠木DNA提取及其ISSR标记鉴别[J]. 四川农业大学学报, 2016, 34(04): 450-455,477.
[5]	韩琳娜, 康玉秋, 郭庆梅, 周凤琴, 张永清. 道地产区金银花的ISSR遗传多样性分析[J]. 四川农业大学学报, 2013, 31(04): 414-418.
[6]	韩琳娜, 周凤琴. 引种紫锥菊的ISSR和SRAP遗传多样性分析[J]. 四川农业大学学报, 2012, 30(04): 439-444.
[7]	李键, 范文洁, 陈昕, 谢安强, 洪伟, 吴承祯. 不同地理种源雷公藤的RAPD分析[J]. 四川农业大学学报, 2011, 29(03): 327-333.
[8]	沙莉娜, 凡星, 杨瑞武, 王晓丽, 周永红. 赖草属植物的表型分支系统学分析[J]. 四川农业大学学报, 2009, 27(01): 6-13.
[9]	刘静, 丁春邦, 杨瑞武, 周永红. 小麦族猬草属和赖草属物种的叶表皮微形态研究[J]. 四川农业大学学报, 2009, 27(01): 14-19.
[10]	侯凯, 吴卫, 郑有良, 杨玉霞, 廖凯, 黎开强, 翟娟园. 川产白芷遗传多样性的ISSR分析[J]. 四川农业大学学报, 2008, 26(03): 237-240.
[11]	钟珉菡, 苟琳, 刘静, 周永红, 杨瑞武. 小麦族赖草属植物与近缘二倍体物种的同工酶分析[J]. 四川农业大学学报, 2008, 26(02): 125-130.
[12]	潘远智, 庞博, 孙振元, 陈强. 雅江报春天然居群RAPD遗传多样性[J]. 四川农业大学学报, 2008, 26(01): 28-31.
[13]	陈良华, 胡庭兴, 张帆. 核桃与铁核桃种间关系的RAPD鉴定[J]. 四川农业大学学报, 2007, 25(04): 513-516.
[14]	杨永超, 李焕秀, 陈佳, 张海利, 罗飞. RAPD标记分析番茄亲本及其F₁的遗传距离和杂种优势[J]. 四川农业大学学报, 2007, 25(03): 267-270.
[15]	刘静, 杨瑞武, 张海琴, 周永红. 猬草属及其近缘属种子胚乳细胞多样性研究[J]. 四川农业大学学报, 2007, 25(01): 14-18.

猬草属与其近缘属物种的RAPD和ISSR分析

Phylogenetic Relationships among Hystrix, Psathyrostachys and Leymus(Poaceae: Triticeae) Based on RAPD and ISSR Assays

PDF (PC)

赞

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

Metrics

本文评价

推荐阅读 10