不同苦瓜品种MAP30基因的克隆及序列分析

doi:10.16036/j.issn.1000-2650.2007.01.012

四川农业大学学报 ›› 2007, Vol. 25 ›› Issue (01): 58-62.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2007.01.012

不同苦瓜品种MAP30基因的克隆及序列分析

杨洲平, 黄乾明, 刘一江, 陈平

四川农业大学生命科学与理学院, 四川雅安 625014

收稿日期:2006-12-11 出版日期:2007-03-31 发布日期:2017-03-03
基金资助:
四川农业大学科技创新基金(007731200)。

Cloning and Sequence Analysis of the MAP30 Gene from Balsam Pear (Momordica charantia)Cultivars

YANG Zhou-ping, HUANG Qian-ming, LIU Yi-jiang, CHEN Ping

College of Biology and Science, Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, Sichuan, China

Received:2006-12-11 Online:2007-03-31 Published:2017-03-03

摘要/Abstract

摘要： 采用PCR法从精选白皮苦瓜(JX)、穗农牌早优苦瓜(ZY)、碧翠苦瓜(BC)、银田牌长白苦瓜(YT)和银田牌蓝山大白苦瓜(LAN)5个品种中克隆到5个长度均为861 bp的MAP30基因JX-MAP30、ZY-MAP30、BC-MAP30(Genebank accession No:DQ643967)、YT-MAP30(No:DQ643968)和LAN-MAP03。序列分析表明,BC-MAP30和YT-MAP30与已报道的MAP30基因分别存在2个和3个碱基的不同,均编码263个氨基酸残基组成的成熟蛋白,与其他葫芦科植物的Ⅰ型核糖体失活蛋白类以及天花粉毒蛋白、多花白树毒蛋白、肥皂草毒素的同源性分别为68.90%、82.75%、71.25%和66.45%,其90~220位氨基酸序列较为保守。二级结构预测表明,BC-MAP30和YT-MAP30编码的成熟肽在N端均有一个延伸的6个β片层。

关键词: 核糖体失活蛋白, 苦瓜, MAP30, 克隆, 序列分析

Abstract: In this study, five MAP30(momordica anti-H IV protein of 30 kD) genes (JX-MAP30, ZY-MAP30, BC-MAP30, YT-MAP30 and LAN-MAP30) were cloned from five Balsam pear (Momordica charantia) cultivars.861 bp sequence was obtained by using poly merase chain reaction (PCR).Sequence analy sis revealed that there were two different bases in BC-MAP30 and three bases in YT-MAP30.The open reading frame of the gene encoded a 263-amino acid matured peptide.The sequence identity with other cucurbitaceous Ribosome inactivating proteins (RIPs) was up to 68.90%, with TCS was 71.25%, with Gelonin was 71.25%, and with Sapo rin was 66.45%.The amino sequence 90 to 220 was conservative sequence.Secondary structure showed that matured peptides encoded by BC-MAP30 and YT-MAP30 formed six successive β sheet.

Key words: Ribosome inactivating pro teins, Balsam pear (Momordica charantia), MAP30, cloning, sequence analysis

中图分类号:

S642.501

杨洲平, 黄乾明, 刘一江, 陈平. 不同苦瓜品种MAP30基因的克隆及序列分析[J]. 四川农业大学学报, 2007, 25(01): 58-62.

YANG Zhou-ping, HUANG Qian-ming, LIU Yi-jiang, CHEN Ping. Cloning and Sequence Analysis of the MAP30 Gene from Balsam Pear (Momordica charantia)Cultivars[J]. jsau, 2007, 25(01): 58-62.

[1]	王梦, 周靖宣, 占思远, 王林杰, 李利, 张红平, 仲涛. 山羊EDNRA基因编码区克隆与组织表达规律分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(06): 852-859.
[2]	陈潇潇, 罗红艳, 顾真琪, 陈世品, 曹光球, 曹世江. 油茶CoFAD2-1基因的克隆、亚细胞定位及组织表达[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(04): 475-480.
[3]	周明, 李彪, 欧阳菠, 钟赟, 杨建东. 绿尾虹雉（Lophophorus lhuysii）Toll样受体5基因的克隆和适应性进化分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 232-240.
[4]	刘裕峰, 朱天辉, 刘应高, 谯天敏, 李姝江, 龙旭梅, 韩珊. 板栗过氧化氢酶基因CmCAT的克隆与原核表达[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 168-176.
[5]	欧阳菠, 张明, 蔡永华, 杨营, 郑程莉, 程建国, 周明, 李彪, 钟赟, 徐丰奕, 杨建东. 林麝（Moschus moschiferus）FSHR基因的克隆及进化分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(02): 259-265.
[6]	姚攀锋, 吕兵兵, 李琪, 董玘鑫, 王安虎, 吴琦. 苦荞转录因子基因FtMYC的克隆及其表达与花青素积累的相关性分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(01): 8-14.
[7]	刘柄良, 杨琳, 付凤玲, 李晚忱, 张君诚, 于好强. 金线莲辣椒红素/玉红素合成酶基因CCS的克隆及表达模式分析[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(01): 22-27.
[8]	黄晓婧, 赵雪雯, 吕秀兰, 梁东. 甜樱桃GalDH、GalLDH的克隆及在果实发育过程的表达[J]. 四川农业大学学报, 2019, 37(01): 47-52.
[9]	阳明贤, 左之才, 李碧, 王宇. 牛抵抗素克隆及高效可溶性表达研究[J]. 四川农业大学学报, 2018, 36(06): 802-807.
[10]	李青青, 张润敏, 石冠蓝, 姚攀锋, 王晓丽, 李成磊. 苦荞黄酮醇合酶基因FtFLS4的克隆及其在大肠杆菌的表达[J]. 四川农业大学学报, 2018, 36(05): 611-617.
[11]	尹国友, 王林嵩. PRRSV-GP5基因的克隆及其B细胞抗原表位预测与分析[J]. 四川农业大学学报, 2016, 34(02): 234-238.
[12]	竭航, 陈彬龙, 吴楠, 李地艳, 雷美艳, 张承露, 曾德军. 梅花鹿LHβ基因的克隆及序列分析[J]. 四川农业大学学报, 2015, 33(04): 441-446.
[13]	韩霜, 逯昀. 菊花CmLhcb1基因的克隆及其转基因植株的筛选[J]. 四川农业大学学报, 2015, 33(01): 6-12.
[14]	张烨, 赵术珍, 王江山, 夏晗, 侯蕾, 任丽, 王兴军. 花生光敏色素AhphyA和AhphyB基因的克隆及原核表达研究[J]. 四川农业大学学报, 2015, 33(01): 13-21.
[15]	赵海霞, 赵培培, 吴小峰, 陈惠, 吴琦. 短小芽孢杆菌胶原蛋白酶基因col_a的克隆及序列分析[J]. 四川农业大学学报, 2011, 29(04): 524-527.

不同苦瓜品种MAP30基因的克隆及序列分析

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