利用RAMP标记研究24份优质抗稻瘟病水稻种质资源的遗传多样性

doi:10.16036/j.issn.1000-2650.2007.01.005

四川农业大学学报 ›› 2007, Vol. 25 ›› Issue (01): 24-28,33.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2007.01.005

利用RAMP标记研究24份优质抗稻瘟病水稻种质资源的遗传多样性

刘巧稚¹, 黄富¹, 谢戎², 刘成元², 黄锐¹, 张晋¹, 叶华智¹

1. 四川农业大学农学院, 四川雅安 625014;
2. 四川省农业科学院水稻高粱研究所, 四川泸州 646100

收稿日期:2006-12-26 出版日期:2007-03-31 发布日期:2017-03-03
基金资助:
四川省育种攻关项目;四川省应用基础项目和四川农业大学人才引进项目资助。

Study on the Genetic Diversity of 24 Good Quality Rice Germplasm Resources Resis tant to Rice Blast based on Random Amplified Microsatellite Polymorphism (RAMP)

LIU Qiao-zhi¹, HUANG Fu¹, XIE Rong², LIU Cheng-yuan², HUANG Rui¹, ZHANG Jin¹, YE Hua-zhi¹

1. College of Agriculture, Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, Sichuan, China;
2. Rice and Sorghum Research Institute, Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Luzhou 646100, Sichuan, China

Received:2006-12-26 Online:2007-03-31 Published:2017-03-03

摘要/Abstract

摘要： 对24份优质抗稻瘟病水稻种质资源进行了RAMP(random amplified microsatellite polymorphism)标记分析。结果表明,80个RAMP引物组合中,有22个引物组合可扩增出清晰且具多态性的条带。这22个引物组合共扩增出108条带,其中80条具有多态性,占74.1%,每个引物组合可扩增出1~9条多态性带,平均3.6条。RAMP标记遗传相似性系数(GS)平均值为0.462(0.138~0.900)以平均GS值0.462为阈值,可将所有供试材料划分为6类。表明这24份优质抗稻瘟病种质资源具有较丰富的遗传多样性。这些优质抗源材料对选育高产、优质、抗稻瘟病新品种(组合)具有重要利用价值。

关键词: 水稻, 优质, 抗稻瘟病, 种质资源, RAMP标记, 遗传多样性

Abstract: The genetic diversity of 24 good quality rice germplasm resources resistant to rice blast was evaluated by using random amplified microsatellite polymorphism (RAMP) markers.The results showed that 22 out of 80 RAMP primers, which could amplify polymorphic bands clearly, were selected for the PCR amplification of genomic DNA.A total of 108 bands were amplified from 22 primers, while 80 bands (about 74.1%) were polymo rphic.One to 9 poly morphic bands could be amplified from each primer, with an average of 3.6 bands.The RAMP-based genetic similarity (GS) among 24 rice germplasm resources ranged from 0.138 to 0.900.Based on the GS matrix, a dendrogram was constructed by using the unweig hted pair g roup method with arithmetic average (UPDMA).All the 24 rice germplasm resources could be disting uished by RAMP makers.Clustering analysis showed that the 24 tested resources could be classified into 6 groups at 0.462 similarity coefficient.I tindicated that these 24 rice germplasm resources had highly genetic diversity.It was of important value to breed new high-yield and good quality varieties or hybrid ricecom binations resistant to blast.

Key words: rice, good quality, rice blast resistance, germplasm resources, RAPM, genetic diversity

中图分类号:

S511

刘巧稚, 黄富, 谢戎, 刘成元, 黄锐, 张晋, 叶华智. 利用RAMP标记研究24份优质抗稻瘟病水稻种质资源的遗传多样性[J]. 四川农业大学学报, 2007, 25(01): 24-28,33.

LIU Qiao-zhi, HUANG Fu, XIE Rong, LIU Cheng-yuan, HUANG Rui, ZHANG Jin, YE Hua-zhi. Study on the Genetic Diversity of 24 Good Quality Rice Germplasm Resources Resis tant to Rice Blast based on Random Amplified Microsatellite Polymorphism (RAMP)[J]. jsau, 2007, 25(01): 24-28,33.

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利用RAMP标记研究24份优质抗稻瘟病水稻种质资源的遗传多样性

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