四川农业大学学报 ›› 2006, Vol. 24 ›› Issue (03): 325-330.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2006.03.018
鸭源致病性大肠杆菌Ⅰ型菌毛pilA基因序列测定及生物信息学分析
于小娜1,2, 汪铭书1,2, 程安春1,2, 李玲1, 段泽1, 钟传德1,2, 陈孝跃1
- 1. 四川农业大学 动物科技学院, 四川 雅安 625014;
2. 动物疫病与人类健康四川省重点实验室, 四川 雅安 625014
Sequencing and Bioinformation Analysis of TypeⅠ Pili PilA Gene of Pathogenic Escherichia coli Isolated from Ducks
YU Xiao-na1,2, WANG Ming-shu1,2, CHEN An-chun1,2, LI Ling1, DUAN Ze1, ZHONG Chuan-de1,2, CHEN Xiao-yue1
- 1. College of Animal and Technology, Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, Sichuan, China;
2. Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province, Yaan 625014, Sichuan, China
摘要： 据GenBank中人源大肠杆菌pilA基因序列,由Oligo 6.0设计一对引物,以提取的鸭源致病性大肠杆菌基因组为模板,进行PCR扩增,获得了5株鸭源致病性大肠杆菌的pilA基因,序列测定和生物信息学分析表明:鸭源致病性大肠杆菌pilA基因核苷酸序列长度为549 bp,编码182aa,与人源、鸡源及猪源大肠杆菌pilA基因之间核苷酸同源性为87.3%~100.0%,氨基酸同源性为87.5%~100.0%。对不同宿主来源大肠杆菌pilA基因所编码蛋白的二级结构、亲水性、抗原性、抗原表位进行预测分析比较,结果显示Ⅰ型菌毛间具有一定的结构相似性,并存在一定的共同抗原位点;系统进化分析表明,各菌株之间的pilA基因遗传相关性与其宿主来源及血清型之间没有严格的相关性。
中图分类号:
- S858.32
