变性高效液相色谱法检测鸡HSP70基因单核苷酸多态性

doi:10.16036/j.issn.1000-2650.2005.01.019

四川农业大学学报 ›› 2005, Vol. 23 ›› Issue (01): 90-94.doi: 10.16036/j.issn.1000-2650.2005.01.019

变性高效液相色谱法检测鸡HSP70基因单核苷酸多态性

罗庆斌¹, 郑凤珊¹, 杜红丽¹, 张细权¹, 杨关福¹, 邱祥聘², 曾凡同²

1. 华南农业大学动物科学学院, 广州 510642;
2. 四川农业大学动物科技学院, 四川雅安 625014

收稿日期:2005-01-14 出版日期:2005-03-31 发布日期:2017-04-21
基金资助:
国家自然科学基金项目(39970540)。

Single Nucleotide Polymorphisms Detection by Denaturing High Performance Liquid Chromatography in the Chicken HSP70 Gene

LUO Qing-bin¹, ZHENG Feng-shan¹, DU Hong-li¹, ZHANG Xi-quan¹, Yang Guan-fu¹, Qiu Xiang-pin², ZENG Fan-tong²

1. College of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China;
2. College of Animal and Technology, Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, Sichuan, China

Received:2005-01-14 Online:2005-03-31 Published:2017-04-21

摘要/Abstract

摘要： 选取我国20个地方鸡种共591个个体作为实验材料,采用变性高效液相色谱(DHPLC)技术,在鸡HSP70基因的全序列内进行未知SNPs的筛选,对有变异的色谱峰型分别选取2个个体测序,再将同一对引物的所有测序样本的测序结果进行序列的同源性比较,从而识别和确认鸡HSP70基因的未知SNPs。结果分别在4对引物扩增的PCR产物中检出并确认了10个SNPs:A258G、C276G、C507T、C1040A、G1044A、C1431A、T1476C、G1500A、A1529G、C1722T。

关键词: 变性高效液相色谱, 鸡, HSP70基因, 单核苷酸多态性

Abstract: In this research, 591 individuals from 20 different Chinese native chicken breeds were studied. By using DHPLC technology Unknown SNPs were detected in the chicken HSP70 gene sequence and for every mutant chromatographic types, 2 individuals were selected to sequence. Homologous analysis was carried out based on the sequence information of samples that amplified from same primer to identity new unknown SNPs. In the PCR products amplified by primer A5, A6, A7 and A4, 10 SNPs sites (A258G, C276G, C507T, C1040A, G1044A, C1431A, T1476C, G1500A, A1529G and C1722T) are detected.

Key words: denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC), chicken, HSP70 gene, single nucleotide polymorphisms (SNPs)

中图分类号:

S831.2

罗庆斌, 郑凤珊, 杜红丽, 张细权, 杨关福, 邱祥聘, 曾凡同. 变性高效液相色谱法检测鸡HSP70基因单核苷酸多态性[J]. 四川农业大学学报, 2005, 23(01): 90-94.

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变性高效液相色谱法检测鸡HSP70基因单核苷酸多态性

Single Nucleotide Polymorphisms Detection by Denaturing High Performance Liquid Chromatography in the Chicken HSP70 Gene

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